DataSpiderServer x64 版は 64bit アプリケーションとして動作します。
「DataSpiderServer.exe *32」は「java.exe」を起動するためのプロセスで、スクリプトの実行など、DataSpiderServer の処理は「java.exe」が実行しています。
「java.exe」は 64bit アプリケーションとして稼働しているため、DataSpiderServer x64 版は 64bit アプリケーションとして処理を実行しています。
なお、DataSpider Studio についても同様で、「DataSpiderStudio.exe *32」というプロセスが「javaw.exe」というプロセスを起動しています。x64 版をインストールしている場合は、「javaw.exe」は 64bit アプリケーションとして動作します。