Windows には以下に同名のファイルが存在することを確認しているため、ファイル名のみで実行する場合は DataSpider のScriptRunner.exe が起動しない可能性があります。
C:\Windows\System32\ScriptRunner.exe
そのため、ScriptRunner.exe 実行時には以下の絶対パスを指定して実行してください。
$DATASPIDER_HOME\<server|client>\bin\ScriptRunner.exe
※$DATASPIDER_HOMEはDataSpider Servistaをインストールしたディレクトリを表します。