■想定される原因
アンインストーラの仕様として、アンインストール時に削除できないファイルはOS のレジストリに情報を保持し、再起動した後に削除しております。
DataSpiderServer が起動中にアンインストールを実施した場合、稼働中のプロセスがファイルを保持しているため、削除することができません。このため再起動後に削除する対象となります。
OS を再起動する前に、旧バージョンのモジュールを手動で削除して新バージョンをインストールした場合、モジュール名は同一となるため、新しくインストールしたモジュールが削除の対象となるため、ご質問にある状況となります。
■対処方法
再度、アンインストールとインストールをお願いいたします。
また、再度作業を実施される場合には、アップグレードガイドに記載している手順の通り、DataSpiderServer を停止してからアンインストールを実行していただくよう、お願いいたします。