稼働するHULFTの数が最大で1台となるように設定されていれば、Amazon EC2 Auto Scaling機能を使用して運用することが可能です。
AWSのAuto Scaling機能は、スケールアウト方式と認識しています。
HULFTは複数のインスタンス(サーバ)にまたがった負荷分散環境での動作には対応していないため、スケールアウト方式には対応していません。
Auto Scaling側の機能で、HULFTがインストールされたインスタンス(サーバ)の起動数が最大で1個になるように設定されているような場合でしたら、OSごとのバックアップとリストアと同様の状態になると認識しています。
OSごとのバックアップとリストアと同様の状態でしたら、リストアされた環境でのHULFTの運用は動作保証の範囲内です。