下記の既知の問題に該当していると考えられます。
DSS-19642
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・SQL実行によるデータ取得ロジックで、null が返された場合でも後続のロジックで
null と判定されません。
対処方法:スクリプト変数などにロジックの結果を代入し、
後続のロジックで使用してください。
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処理内容によっては上記の対処方法では対応できない場合もあります。
記載の対処方法以外では、[SQL実行によるデータ取得ロジック]の出力結果を[空文字の変換]を使って処理することで、
[Nullチェックロジック]の判定結果が「true」になることが確認されています。